Catalogue de données
56 jeux de données trouvés
Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 379 anguilles d’Amérique (Anguilla rostrata) provenant de l’est du Canada, ayant grandi en eau douce ou en eau saumâtre ou salée, génotypées à l’aide de 42 424 SNP.
Anguilla rostrata(s'ouvre dans un nouvel onglet)American eelAnguilla rostratagenotyping-by-sequencingecotypehabitatpolygenic selectionPériode2009–2011Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 171 bars rayés (Morone saxatilis), dont des poissons introgressés, provenant du Nouveau-Brunswick et de la Nouvelle-Écosse (Canada) et de la Caroline du Nord (États-Unis), génotypés à l’aide de 7 057 SNP.
Morone saxatilis(s'ouvre dans un nouvel onglet)striped bassMorone saxatilisGWASrandom forestgenotyping-by-sequencingpopulation geneticsPériode2014–2017Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 586 homards d’Amérique (Homarus americanus) provenant d’une grande partie de l’aire de répartition de l’espèce au Canada et aux États-Unis, génotypés à l’aide de 10 156 SNP.
Homarus americanus(s'ouvre dans un nouvel onglet)American lobsterHomarus americanuspopulation assignmentpopulation structurefisheries managementgenotyping-by-sequencingPériode2012Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 195 grands corégones (Coregonus clupeaformis) provenant de lacs nord-américains contenant chacun une paire de formes sympatriques naine (limnétique) et normale (benthique), génotypés à l’aide de 3 388 SNP.
Coregonus clupeaformis(s'ouvre dans un nouvel onglet)lake whitefishCoregonus clupeaformisspeciationgenomic islandsgenotyping-by-sequencingspecies pairPériode2010Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 1 495 épinettes noires (Picea mariana) provenant de tests de provenances couvrant l’aire de répartition de l’espèce au Canada et aux États-Unis et d’un groupe externe d’épinette rouge (Picea rubens), génotypées à l’aide de 30 071 SNP.
Picea mariana(s'ouvre dans un nouvel onglet)black sprucePicea marianagenotyping-by-sequencinggenomic offsetcommon gardenPériode2014–2019Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 249 poissons arc-en-ciel du fleuve Murray (Melanotaenia fluviatilis) provenant du bassin Murray-Darling (Australie), génotypés à l’aide de 17 503 SNP.
Melanotaenia fluviatilis(s'ouvre dans un nouvel onglet)Murray River rainbowfishMelanotaenia fluviatilislandscape genomicsdendritic networkRDAgenotyping-by-sequencingPériode2009–2012Ce jeu de données contient les génotypes imputés, obtenus par génotypage par séquençage, de 200 cultivars et sélections de prunier japonais (Prunus salicina) cultivés à la Vineland Research Station (Ontario, Canada), génotypés à l’aide de 20 633 SNP, ainsi que des données de pedigree.
Prunus salicina(s'ouvre dans un nouvel onglet)Japanese plumPrunus salicinablack knotdisease resistanceGWASgenotyping-by-sequencingPériode2015Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 356 saumons chinook (Oncorhynchus tshawytscha) provenant de populations introduites en Patagonie (Chili) et de populations indigènes du Nord-Ouest du Pacifique (États-Unis), génotypés à l’aide de 11 759 SNP. La couverture temporelle correspond aux années des demandes de subvention (2009–2010) ; les dates d’échantillonnage ne sont pas publiées.
Oncorhynchus tshawytscha(s'ouvre dans un nouvel onglet)Chinook salmonOncorhynchus tshawytschainvasive speciesPatagoniagenotyping-by-sequencingpopulation geneticsPériode2009–2010Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 382 femelles adultes de Glypta fumiferanae (Hymenoptera : Ichneumonidae), parasitoïde larvaire de la tordeuse des bourgeons de l’épinette, élevées à partir de larves de tordeuse récoltées en 2014 dans et autour de zones d’épidémie au Québec (Canada), génotypées à l’aide de 1 044 SNP.
Glypta fumiferanae(s'ouvre dans un nouvel onglet)Glypta fumiferanaespruce budwormparasitoidlandscape genomicsgenotyping-by-sequencingPériode2014Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus à l’aide d’une puce de SNP, de 658 saumons atlantiques (Salmo salar) provenant de l’est du Canada, génotypés à l’aide de 97 566 SNP, ainsi que des données phénotypiques.
Salmo salar(s'ouvre dans un nouvel onglet)Atlantic salmonSalmo salarSNP chipage at maturitylife historyparallel evolutionPériode2009–2019Données de génotypage par séquençage de bars rayés de la côte atlantique du Canada et des États-Unis
Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 453 bars rayés (Morone saxatilis) provenant de la côte atlantique du Canada et des États-Unis, du Nouveau-Brunswick et de la Nouvelle-Écosse à la Caroline du Nord, génotypés à l’aide de 6 970 SNP.
Morone saxatilis(s'ouvre dans un nouvel onglet)striped bassMorone saxatilisGWASrandom forestgenotyping-by-sequencingpopulation geneticsPériode2011–2017Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 1 360 capelans (Mallotus villosus) provenant de l’est du Canada, génotypés à l’aide de 17 436 SNP.
Mallotus villosus(s'ouvre dans un nouvel onglet)capelinMallotus villosusgenotyping-by-sequencinggenomicslocal adaptationmarine environmentpopulation geneticsPériode2014Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 441 cerfs de Virginie (Odocoileus virginianus) provenant de l’île d’Anticosti (Québec, Canada), où l’espèce a été introduite il y a environ 120 ans, génotypés à l’aide de 10 596 SNP, ainsi que des données phénotypiques.
Odocoileus virginianus(s'ouvre dans un nouvel onglet)white-tailed deerOdocoileus virginianusfounder effectisland rulegenotyping-by-sequencingmorphometricsPériode2003–2014Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 562 homards d’Amérique (Homarus americanus) provenant de la côte atlantique du Canada et des États-Unis, génotypés à l’aide de 13 688 SNP.
Homarus americanus(s'ouvre dans un nouvel onglet)American lobsterHomarus americanusseascape genomicssea surface temperaturelarval dispersalpopulation geneticsgenotyping-by-sequencingPériode2012Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 717 grandes holothuries de Californie (Apostichopus californicus, syn. Parastichopus californicus) provenant de la côte de la Colombie-Britannique (Canada) et du sud-est de l’Alaska (États-Unis), dans le Pacifique Nord-Est, génotypées à l’aide de 2 718 SNP. L’ADN a été extrait de fragments de papille dorsale (environ 1 cm).
Apostichopus californicus(s'ouvre dans un nouvel onglet)giant California sea cucumberApostichopus californicusseascape genomicsmarine connectivitygenotyping-by-sequencingPériode2014–2015Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 1 156 spongieuses (Lymantria dispar) provenant de l’ensemble de l’aire de répartition de l’espèce, de l’Amérique du Nord au Japon, génotypées à l’aide de 285 SNP diagnostiques de la provenance. Tous les individus sont des mâles, d’un âge noté de 1 mois. L’ADN a été extrait de pattes.
Lymantria dispar(s'ouvre dans un nouvel onglet)spongy mothLymantria dispargenotyping-by-sequencinginvasive speciesPériode2013–2016Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 1 975 tordeuses des bourgeons de l’épinette (Choristoneura fumiferana) provenant de l’ensemble du Canada et des États-Unis, génotypées à l’aide de 3 650 SNP.
Choristoneura fumiferana(s'ouvre dans un nouvel onglet)spruce budwormChoristoneura fumiferanaphylogeographypopulation structuregenotyping-by-sequencingforest insect pestPériode2003–2013Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, non imputés, de 486 huîtres américaines (Crassostrea virginica) provenant du golfe du Saint-Laurent (Nouveau-Brunswick, Nouvelle-Écosse et Île-du-Prince-Édouard, Canada), génotypées à l’aide de 11 321 SNP. La couverture temporelle est l’année de la demande de subvention (2016) ; les dates d’échantillonnage ne sont pas publiées.
Crassostrea virginica(s'ouvre dans un nouvel onglet)eastern oysterCrassostrea virginicaseascape genomicsgenotyping-by-sequencinglandscape genomicsGulf of St. LawrencePériode2016Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 596 morues franches (Gadus morhua) juvéniles et adultes provenant de l’Atlantique Nord-Ouest au large de Terre-Neuve et des zones adjacentes (Canada), génotypées à l’aide de 1 887 SNP.
Gadus morhua(s'ouvre dans un nouvel onglet)Atlantic codGadus morhuachromosomal inversionsupergenelife stagegenotyping-by-sequencingNAFOpopulation geneticsPériode2013–2018Ce jeu de données contient les génotypes, obtenus par génotypage par séquençage, de 100 échantillons de mouettes blanches (Pagophila eburnea) provenant de colonies de reproduction de l’Arctique (Canada, Groenland et Svalbard), génotypés à l’aide de 5 912 SNP.
Pagophila eburnea(s'ouvre dans un nouvel onglet)ivory gullPagophila eburneaseabirdbottleneckeffective population sizegenotyping-by-sequencingPériode2006–2012

